Η Haruhi είναι άλλη μια «συνηθισμένη» βαρετή μαθήτρια γυμνασίου που δεν ενδιαφέρεται για τους "κοινούς θνητούς", αλλά πιστεύει ότι δεν είμαστε μόνοι μας σε αυτόν τον κόσμο. Αν υπάρχουν εξωγήινοι, μαχητές από το μέλλον, ή άνθρωποι με ειδικές δυνάμεις, η Haruhi θα είναι σίγουρα η πρώτη που θα τους ανακαλύψει και θα τους δεχτεί με ανοιχτά τα χέρια.
Έτσι λοιπόν με αυτό το πάθος της, αποφασίζει να ανοίξει το πρώτο club του σχολείου εν ονόματι "SOS Dan" και με θέμα το "παραφυσικό" προσκαλώντας όλους τους "εξωγήινους" να την ακολουθήσουν. Κάνοντας μια "καλή αρχή", τα πρώτα μέλη, ο Kyon άλλος ένας ο βαρετός μαθητής, και η πανέμορφη Mikuru αναζητούν νέα μέλη για το club με πρωτοποριακούς και ενδιαφέρων τρόπους.
Μήπως όμως όλα αυτά που αναζητεί με πάθος η Haruhi, είναι μπροστά της;