Το 1969 ήταν η αρχή της έξαρσης της οικονομικής δραστηριότητας. Ωστόσο, στις σκιές κρυβόταν ένας μελλοντικός εχθρός του οποίου η παρουσία ήταν γνωστή από λίγους. Αυτός ο εχθρός συγκρότησε την ομάδα των "Invaders" και αναμείχθηκε με τους απλούς ανθρώπους. Αυτά τα μυστηριώδη πλάσματα έχουν προκαλέσει πολλά ατυχήματα και την αντιμετώπιση τους έχει αναλάβει Οργάνωση Άμυνας της Γης (AEGIS) με την βοήθεια των Gate Keepers, ατόμων που μπορούν να ανοίξουν μια διάσταση σε ένα άλλο κόσμο και να εξάγουν μεγάλες ποσότητες δύναμης, κατάλληλες για την εξόντωση των Invaders.
Έτσι, σε μια καταδίωξη των Invaders, αφού η Ikusawa Izuniko έχει απότυχει στην εξόντωση τους, ένα αγόρι που ονομάζεται Ukia Shun ανακαλύπτει τις δυνάμεις του, που ούτε ο ίδιος γνώριζε. Η μάχη εναντίον των Invaders αρχίζει και νέα μέλη μπαίνουν στην συνέχεια στην ομάδα των Gate Keepers.