Η ιστορία ξεκινά με ένα 11χρονο αγόρι, τον Nakahito Kagura, ο οποίος αναγκάζεται από συμμαθητές του να μπει σε ένα σπίτι που φημολογείται οτι ανήκει σ'έναν τρελό επιστήμονα. Μέσα στο σπίτι βρίσκει μια ανθρώπινη κούκλα. Την ίδια στιγμή ο ιαπωνικός στρατός επιτίθεται στο σπίτι και η "κούκλα" πέφτει πάνω στον Nakahito και εκείνος κατα λάθος την φιλάει, δίνοντάς της έτσι ζωή.
Η κούκλα ξυπνάει και μετατρέπεται σε μια Steel Angel, την Kurumi, που κυνηγάει ο στρατός για μυστηριώδεις λόγους..!